Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms