Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5XFZ0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms