Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col27a1Q5QNQ9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms