Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms