Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps41Q5KU39 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms