Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri2Q5BKS4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms