Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufaf2Q59J78 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms