Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Carmil2Q3V3V9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Carmil2Q3V3V9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms