Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms