Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo3bQ1EG27 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms