Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Traf3ip1Q149C2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Traf3ip1Q149C2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3ip1Q149C2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Traf3ip1Q149C2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms