Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ncf1Q09014 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ncf1Q09014 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms