Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cass4Q08EC4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms