Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms