Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apoc2Q05020 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms