Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfiaQ02780 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms