Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms