Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabpb1Q00420 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb1Q00420 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms