Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf6P70279 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf6P70279 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms