Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn5P68500 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms