Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gsc2P56916 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gsc2P56916 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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