Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pms2P54279 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms