Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fgf9P54130 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms