Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms