Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnnt2P50752 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms