Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Saa4P31532 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Saa4P31532 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms