Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms