Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CtsgP28293 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms