Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms