Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tap1P21958 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tap1P21958 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tap1P21958 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tap1P21958 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms