Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnnc2P20801 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms