Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VimP20152 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VimP20152 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VimP20152 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VimP20152 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VimP20152 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms