Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt8P11679 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms