Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd4P10628 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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