Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifnb1P01575 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms