Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms