Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms