Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pja1O55176 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms