Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms