Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3O54890 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms