Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CltaO08585 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CltaO08585 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CltaO08585 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CltaO08585 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CltaO08585 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltaO08585 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltaO08585 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltaO08585 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltaO08585 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltaO08585 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltaO08585 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltaO08585 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltaO08585 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltaO08585 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltaO08585 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltaO08585 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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