Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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