Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Calhm3J3QMI4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms