Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cald1E9QA15 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms