Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r238E9Q373 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms