Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms