Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms