Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms