Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip3B9EHT4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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