Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apol6B7ZC55 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms